Perkantas Riau berdiri pada tanggal 2 Oktober 1999 di GPIB Jl. Sumatra, Pekanbaru. Namun jauh sebelumnya, pelayanan Perkantas sudah dimulai ketika Perkantas Medan beberapa kali mengadakan pembinaan kepada mahasiswa Kristen di Universitas Riau (UNRI). Beberapa alumni dan dosen juga telah lama berdoa dan mulai merintis pelayanan. Pelayanan mahasiswa di UNRI diawali dengan KK, Kamp Penginjilan, Kamp Pembinaan, dan beberapa kali mengutus mahasiswa mengikuti Kamp Regional Sumbagut, Sumbagsel, dan Jakarta.
Pada tahun yang sama (1999), Pelayanan Alumni Kristen (PAK) Perkantas Riau resmi berdiri dengan kerinduan alumni sebagai buah pelayanan mahasiswa tetap terpelihara dan dapat menjadi berkat. Pelayanan PAK meliputi KTB alumni, kebaktian bulanan, seminar, Pembinaan Pra-alumni, dan dalam perkembangan pelayanan selanjutnya, pelayanan pasutri.
Dua tahun setelahnya, PMK Kota Riau resmi berdiri dengan tujuan terjadinya kegerakan pelayanan mahasiswa se-kota. Dalam misinya, PMK kota merintis ke kampus-kampus dan mengembangkan pelayanan mahasiswa di UNRI. Adapun kampus yang sudah dilayani saat ini, antara lain: Universitas Riau dan Universitas Islam Riau (tahap perintisan).
Dalam perkembangan pelayanan selanjutnya, Perkantas juga melayani siswa, sehingga pada tahun 2003, pelayanan siswa resmi dimulai melalui pembentukan Tim Pembimbing Siswa (TPS). TPS menginjili siswa dan membinanya dalam KK. Sekolah yang sudah dilayani adalah SMK Pertanian, SMA Dharmaloka, dan SMA Dharmayudha.
Sejak bulan September 2014, Perkantas Riau melakukan perintisan ke daerah Kerinci (+/- 2 jam dari Pekanbaru).
Potensi pelayanan di Riau begitu besar dan luas, dan dalam tangan kemurahan Tuhan, Perkantas Riau siap mengemban visi-misi-Nya melayani generasi muda: siswa, mahasiswa, dan alumni, bagi pembangunan Indonesia yang sejahtera. Segala kemuliaan hanya bagi Tuhan!