Pelayanan Medis Nasional (PMdN) merupakan divisi pelayanan yang secara khusus ditujukan kepada mahasiswa maupun alumni medis (kedokteran, kedokteran gigi, kebidanan, keperawatan, dsb.). Melalui pelayanan ini, diharapkan munculnya tenaga-tenaga profesional di bidang medis yang sungguh-sungguh melayani Tuhan dan sesama di dalam kasih. Dengan demikian, diharapkan pula agar makin banyak masyarakat yang mengenal kasih Tuhan lewat murid-murid Kristus yang bergerak di bidang kesehatan ini.
Berbagai program untuk memperlengkapi para mahasiswa dan alumni medis telah dijalankan, antara lain Medical Mission Course (MMC), Kamp Medis Nasional (KMdN) untuk mahasiswa maupun KMdN untuk alumni, penerbitan buku PA Medis berjudul “Dokter yang Memperkenankan Hati Tuhan”, penerbitan majalah Samaritan, dsb.